Bermula dari pemberian tanah wakaf untuk masjid Baitul Muttaqin, kemudian pada tanggal 6 April 1990 didirikanlah Yayasan Baitul Muttaqin. Berdasarkan rapat pengurus Yayasan Baitul Muttaqin maka sepakat mendirikan SD Islam Darul Huda pada tahun 2001, dan ijin operasional sekolah dari Dinas Pendidikan Kota Semarang pada tanggal 11 Juli 2003 dengan nomor 050.7/2115.

Sekolah ini beralamat di Jalan Wolter Monginsidi Kelurahan Genuksari Kecamatan Genuk Kota Semarang Propinsi Jawa Tengah. Kondisi sekolah ini di awal pendiriannya masih memprihatinkan. Beberapa tantangan yang dihadapi menyangkut sarana dan prasarana antara lain sekolah ini belum punya ruang kelas yang layak, dan kondisi jalan masuk ke sekolah melewati halaman Masjid Baitul Muttaqin. Sekolah ini memiliki jumlah siswa yang sedikit di mana rata-rata kelas hanya diisi 16 siswa dari normal sebanyak 40 siswa.

Dari sisi sumber daya manusia, data guru yang ada hanya 6 orang berstatus Guru Tidak Tetap Sekolah ini tidak memiliki pegawai Tata Usaha dan Kepala Tata Usaha. Kondisi ini terasa berat secara keuangan sekolah karena gaji guru dan karyawan ditanggung sekolah.